Терминаторные кодоны

Терминаторный кодон -напротив А-участка [c.48]

Рис. 11.13. Терминация синтеза полипептида происходит тогда, когда терминаторны кодон (в данном случае UGA) попадает в А-участок рибосомы и узнается белковым фактором терминации RF2.

Генетическое подтверждение существования терминаторных кодонов [c.74]

Д. Связывается с терминаторными кодонами и индуцирует дальнейший синтез белка. [c.75]

На рис. 3 дан полный кодовый словарь. Из 64 триплетов, получивших название кодонов, 61 являются значащими (смысловыми) в том смысле, что кодируют аминокислоты. Только 3 кодона —UAG ( янтарь ), UAА ( охра ) и UGA ( опал ) — не кодируют никакой аминокислоты и потому иногда называются бессмысленными . Роль бессмысленных триплетов в трансляции очень важна, так как в мРНК они служат сигналом терминации синтеза полипептидной цепи белка в настоящее время их обычно называют терминаторными кодонами. [c.15]

Рис. 12.6. Нуклеотидная последовательность ДНК генома фага фХ174 s70. Над нуклеотидной последовательностью приведены аминокислотные последовательности кодируемых белков. Последовательность кольцевой фаговой ДНК начинается после терминаторного кодона Н-белка. Нумерация начинается от уникального сайта расщепления рестриктазой Pst I. Слева от последовательности поставлены буквы, отражающие название белка, кодируемого данным участком генома. Сайты узнавания для ряда рестриктаз помечены под соответствующими участками последовательности, при этом использованы следующие обозначения

Хорошим примером полицистронной мРНК является РНК малого РНК-содержащего бактериального вируса (фага) MS2. Фаг MS2 — сферический он имеет диаметр 2,5 нм и молекулярную массу 3,6 10 дальтон. Фаг построен из 180 субъединиц белка оболочки с молекулярной массой 14700 дальтон каждая, одной молекулы так называемого А-белка с молекулярной массой 38000 дальтон и одной молекулы РНК с молекулярной массой 10 дальтон. После попадания фага в клетку Е. соИ (а также в бесклеточной системе трансляции) эта РНК служит матрицей для белка оболочки, А-белка и субъединицы РНК-репликазы с молекулярной массой 62000 дальтон, которая в состав фага не входит. Схема расположения соответствующих цистронов вдоль цепи этой мРНК дана на рис. 6. Цепь начинается с G, имеющего трифосфат на своем 5 -гидроксиле. Далее следует длинная некодирующая нуклеотидная последовательность. Общая длина 5 -концевой некодирующей последовательности 129 остатков в ней встречаются триплеты AUG и GUG, которые, однако, не являются инициаторными. Первый инициаторный кодон, GUG, начинает кодирующую последовательность А-белка (А-цистрон). А-цистрон имеет длину 1179 остатков и заканчивается терминаторным кодоном UAG. Затем идет некодирующая вставка длиной 26 остатков. Следующая кодирующая последовательность начинается с AUG и имеет длину 390 остатков это —цистрон белка оболочки (С-цистрон). Он оканчивается терминаторным кодоном UAA, и за ним непосредственно следует второй терминаторный кодон UAG. Последовательность длиной 36 остатков отделяет С-цистрон от S-цистрона, кодирующего субъединицу РНК-синте-тазы. S-цистрон начинается с AUG, имеет длину 1635 остатков и заканчивается UAG. За ним через один остаток (т. е. не в фазе) имеется еще один терминаторный триплет UGA. З -концевая некодирующая последовательность имеет общую длину 174 остатка и заканчивается аденозином со свободной г/мс-гликольной группиров- [c.20]

Рис. 11.18. Последовательность куриной овальбуминовой мРНК. Остатки 13-1872 присутствовали в ДНК плазмиды рОУ 230 остатки 1-12 и 1731-1872 были определены непосредственно по последовательности мРНК. Звездочкой помечен овальбуминовый терминаторный кодон. Зрелый овальбумин [в структуре которого отсутствует К-конце-вой (инициаторный) метионин] имеет сле-

В связи с рассмотрением РНК фага MS2, следует указать также на другой способ размещения разных кодирующих последовательностей в одной мРНК. Дело в том, что MS2 РНК кодирует еще и четвертый белок, названный белком лизиса, или L-белком (он, повидимому, участвует в лизисе хозяйской клетки на завершающей фазе инфекции). Этот белок закодирован участком РНК, начинающимся в конце С-цистрона, захватывающим всю 36-нуклеотидную вставку между С-цистроном и S-цистроном и заканчивающимся в пределах S-цистрона рамка считывания этого перекрывающегося L-цистрона сдвинута вправо на один остаток (+1 сдвиг), так что никакие его участки не транслируются при синтезе С-белка и S-белка. L-цистрон имеет свой инициаторный кодон AUG, не в фазе с кодонами С-цистрона, и, соответственно, свой терминаторный кодон UAA, не в фазе с кодонами S-цистрона. Эта ситуация изображена на рис. 7. Использование перекрывающихся кодирующих последовательностей в пределах одной мРНК встречается, однако, не часто и свойственно, по-видимому, в основном вирусным системам, где экономия места для размещения цистронов играет особенно важную роль. [c.21]

Из трех терминирующих кодонов самым слабым является UGA. Он чаще всего может проскакиваться транслирующей рибосомой, по-видимому, за счет его узнавания триптофановой тРНК. В некоторых случаях этот терминирующий кодон специально используется в природе для того, чтобы в дополнение к основному белковому продукту, синтез которого завершается на этом кодоне, происходило образование небольших количеств другого физиологически важного белка из удлиненного полипептида. Такая ситуация наблюдается при трансляции РНК фага Q цистрон белка оболочки фага заканчивается терминаторным кодоном UGA, который время от времени проскакивается рибосомами, что приводит к синтезу небольших количеств значительно более длинного, чем белок оболочки, полипептида последний является необходимым продуктом трансляции фаговой РНК, так как требуется для сборки полноценной (инфекционной) фаговой частицы. [c.266]

Полипептидный синтез по данной матрице продолжается до тех пор, пока в А-участке не окажется терминаторный кодон мРНК. Обычно терминация трансляции может задаваться тремя различными кодонами-UAA, UAG и UGA. Последовательность оснований в этих кодонах узнается специализированными белковыми факторами терминации. У Е. oli имеются два таких белка-RFl и RF2 первый узнает кодоны [c.47]

UAA и UAG, а второй-кодоны UAA и UGA. У эукариот все три кодона узнает, по-видимому, один и тот же белок. Когда в А-участке оказывается терминаторный кодон, туда же подходит и терминирующий белок, который вынуждает пептидилтрансферазу сделать холостой шаг, в результате законченная полипептидная цепь высвобождается и отделяется от рибосомы (рис. 11.13). Рибосомные субъединицы в свою очередь диссоциируют, отделяются от мРНК и могут принять участие в синтезе следующей полипептидной цепи. [c.48]

Понятие генетический код часто упоминалось в гл. И, поскольку оно лежит в основе представления о механизме биосинтеза белка. Современные знания о генетическом коде накапливались параллельно с детальным изучением молекулярных основ процессов транскрипции и мутагенеза. Эти вопросы, к решению каждого из которых исследователи подходили незавимимым путем, в действительности тесно связаны между собой. Мы уже отмечали, что основными знаками генетического кода служат нуклеотидные триплеты, считываемые последовательно без перекрывания от 5 - к З -концу цепи мРНК. Трансляция начинается со специализированного инициаторного кодона AUG, который определяет рамку считывания последующих кодонов, и продолжается до тех пор, пока не встретится терминаторный кодон. Этот процесс сопровождается сборкой полипептида с фиксированной аминокислотной послейова-тельностью. Синтез полипептида ведется в направлении от N-конца к С-концу. [c.67]

Аналоги нуклеиновых оснований, вызывающие мутации, отличные от сдвига рамки, также могут индуцировать такие мутации в Л-участке слитого цистрона, которые влекут за собой потерю В-функции. Некоторые из этих мутаций, которые сводятся к замещению единичных нуклеотидов, принадлежат к классу супрессируемых летальных атЬег-му-таций (см. гл. 7). Возможное объяснение природы влияния атЬег-мута.-ции в Л-участке на экспрессию В-белка могло заключаться в том, что благодаря этой мутации возникает терминаторный кодон, предотвра-щаюцщй трансляцию В-участка слитой мРНК. [c.74]

После того как генетический код был полностью расшифрован, были разработаны методы определения нуклеотидных последовательностей ДНК и РНК, которые позволили окончательно убедиться в правильности расшифровки и универсальности кода. Определение первичной структуры природных мРНК, например мРНК куриного овальбумина (рис. 11.18), показало, что аминокислотную последовательность белка можно прочитать непосредственно по соответствующей нуклеотидной последовательности с помощью таблицы генетического кода. При этом было установлено, что терминаторные кодоны, об определении структуры которых рассказывалось в предыдущем разделе, действительно выступают в роли сигналов терминации трансляции. Более того, удалось получить представление о некоторых достаточно неожиданных способах, с помощью которых может осуществляться зашифровка генетической информации, а также ее выражение в ходе транскрипции и трансляции. [c.83]

Генетический код, используемый в митохондриях, удалось расшифровать с помощью сопоставления аминокислотных последовательностей митохондриальных белков с соответствующими фрагментами нуклеотидной последовательности митохондриальной ДНК. Так, оказалось, что и у дрожжей, и у млекопитающих триптофан кодируется как триплетом UGG, так и триплетом UGA, который, согласно табл. 12.1, служит терминаторным кодоном. Например, в аминокислотной последовательности субъединищ.1 II митохондриальной щ1тохром-с-оксидазы человека из пяти остатков триптофана три соответствуют кодону UGA, а два других-кодону UGG. Поэтому ясно, что кодон UGA в митохондриях человека не может выступать в роли терминатора трансляции. Расшифрованный таким образом генетический код, используемый в митохондриях человека, представлен в табл. 12.9. Среди других отличий от обычного универсального кода можно отметить то, что кодон AUA вместо изолейцина кодирует метионин, а триплеты AGA и AGG являются не аргининовыми кодонами, а сигналами терминации трансляции. [c.96]

Митохондриальный генетический код Мутация со сдвигом рамки nonsense-Мутация Перекрывающиеся кодирующие последовательности Правила неоднозначного соответствия Терминаторный кодон [c.101]

Существуют также различия между прокариотами и эукариотами по использованию кодонов, терминирующих трансляцию. В эукариотических мРНК используются все три терминаторных кодона (UAA, UGA и UAG), но чаще кодон UAA. В прокариотических мРНК терминация в основном происходит на шдоне UAA. Обнаружено, что на эффективность терминации трансляции также влияют последовательности мРНК, прилегающие к терминатор-ному кодону. Причем для про- и эукариот они различаются. [c.157]

Мутация Aaml8 сказывается на структуре продукта гена В, вызывая замену Ala -> Val, которая, однако, не оказывает заметного влияния на функционирование белка, продукта гена В. Замена еще одного нуклеотида проявляется в аминокислотной замене Glu -> -> Gln, которая придает белку В температурочувствительность, и в то же время сопровождается удалением терминаторного кодона в гене А, приводящем к образованию полностью функционального белка А. [c.284]

Мутации — вставки и выпадения вблизи терминаторного кодона в пределах генов для а- и р-цепи — приводят к появлению более длинных, чем в норме, соответственно а- и р-цепей глобина, поскольку естественные кодоны-терминаторы (в обоих случаях UAA) оказываются не в фазе и трансляция иРНК продолжается дальше, пока рибосома не встречает новый кодон-нонсенс. Это, в частности, гемоглобин Констант Спринг (Hb S), содержащий 31 лишний аминокислотный остаток в а -цепи, и некоторые другие формы. [c.515]

Терминация изучена слабее чем другие этапы трансляции еичас ее с а и ш ать о-раздо интенсивнее, поскольку выяснилось что этот этап тоже важен для регуляции в клетках Думают, что когда транс ыционный процесс достигает терминаторного кодона, возникает пау-а после которой, в принципе могут быть разнь е события, терминация, включение специа ь-нои аминокиеаоты, проч ение случайной аминокис отой, и и сдвиг рамки [c.62]

В случае генов RMPst I отмечается наличие в составе иРНК, расположенных за терминаторным кодоном последовательностей, способных образовать шпилечные структуры [385]. Вопрос об их участии в регуляции экспрессии остается открытым. [c.113]

Смотреть страницы где упоминается термин Терминаторные кодоны: [c.622] [c.20] [c.24] [c.155] [c.266] [c.210] [c.82] [c.82] [c.83] [c.91] [c.92] [c.92] [c.94] [c.99] [c.100] [c.233] [c.73] [c.108] [c.113] [c.157] [c.165]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология