ПОИСК Статьи Рисунки Таблицы Стратегии секвестрования полных геномов из "Секвенирование ДНК" Кроме этой декларации существует множество других международных документов, также связанных с этико-правовыми аспектами данного проекта, достаточно широкая подборка которых проведена коллективом авторов [Иванов, Юдин и др., 1998]. [c.372] Рассматриваемые в гл. 8 стратегии секвенирования протяженных фрагментов ДНК ориентированы, в основном, на определение последовательности нуклеотидов в клонированных вставках длиною от 2 тпн до 45 тпн, что соответствует клонам в обычных плазмидных или космидных векторах. Однако простое переложение этих стратегий для секвенирования полных геномов невозможно, поскольку здесь должен действовать комплексный подход. Более того, учитывая большой объем предстоящей работы при секвенировании целых геномов организмов, должен соблюдаться некий баланс между производительностью выбранного метода, включая избыточность, получаемой с его помощью информации и стоимостью всего проекта. Это вместе с большими размерами геномов как бактерий, так и тем более высших организмов диктует свои особенности. Для последних считается, что усилия, прилагаемые на этапе картирования генома, должны соотноситься с тем количеством нуклеотидов, которые необходимо определить [Roa h et al., 1995]. [c.373] Но и работа даже с такой полностью случайной клонотекой неизбежно приведет к повторному секвенированию одних и тех же участков ДНК, незначительно сдвигающихся от клона к клону. Не очень сложные математические расчеты показывают, чтобы полностью секвенировать почти весь геном, необходимо определить количество нуклеотидов, более чем в 10 раз превышающее необходимое. Табл. 11.1 позволяет сопоставить общее количество прочитанных нуклеотидов и достигаемое при этом покрытие генома. [c.374] Считается, что современная техника секвенирования ДНК позволяет завершить проект определения нуклеотидной последовательности какого-либо прокариотического организма с геномом до 2 мпн за 6 мес, если задействовать требуемое число сотрудников и получить должное финансирование. Секвенирование геномов с размерами от 2 до 6 мпн уже требует значительно большего времени, значительных усилий и средств. Так, считается, что на сегодняшний день стоимость одного определенного нуклеотида составляет около 50 центов и предполагается, что к моменту завершения секвенирования генома человека за счет продолжающегося усовершенствования методов секвенирования ДНК она будет составлять не более 25 центов [ ollins et al., 1998]. [c.376] Вернуться к основной статье