ПОИСК Статьи Рисунки Таблицы Некоторые приемы, облегчающие вывод уравнения стационарной скорости из "Биохимия мембран Кинетика мембранных транспортных ферментов" Вывод уравнения стационарной скорости методом Кинга — Альтмана для сложных механизмов очень трудоемок, так как связан с отысканием большого числа деревьев. С целью упрощения вывода уравнения М. В. Волькенштейном и Б. Н. Гольдштейном (1966) был предложен ряд правил, основанных на теории графов. Ниже приведены некоторые из них. [c.16] Вывод уравнения стационарной скорости облегчается для механизмов, содержащих равновесные стадии. Для таких механизмов, согласно методу Ча (S. ha, 1968), каждую группу форм фермента, находящихся в равновесии, можно рассматривать как единую форму при этом каждая константа скорости ki снижается до величины fiki, где fi — доля реакционноспособных молекул в равновесной смеси. [c.16] Для вывода уравнения стационарной скорости необходимо провести следующие операции 1. Записать в графической форме механизм реакции, включая все константы скорости и обозначая все направления 2. Выделить (очертить кругом) п—1) узел, т. е. форм фермента, где п — число узлов в механизме. Конечный результат не зависит от пропускаемого узла, хотя правильный выбор такого узла может облегчить решение, исключая возможность возникновения циклов 3. Выписать отдельно все константы, пересекающие каждый из (л—1) узлов 4. Выписать все комбинации пар констант, которые покидают каждый отдельный узел графа. [c.17] Эти пары являются запрещенными комбинациями констант скорости 5. Применяя алгебру Уонга и исключая запрещенные комбинации, перечисленные в п. 4, перемножим альфанумерически перечень, полученный в п. 3 6. Результат операции п. 5 является знаменателем уравнения скорости, который рассортирован по каждому узлу, т. е. по выражению или определителю для каждой формы фермента 7. Группирование по узлам, например для формы фермента ЕХ заканчивается отбором тех членов в знаменателе, которые не содержат константы скорости, выходящие из формы EX. [c.17] Перечень констант перемножают альфанумерически (запрещенные комбинации при этом отбрасывают). Введем обозначения М — множитель (в скобках указаны константы, которые при умножении дают запрещенные комбинации) Р — результат умножения по алгебре Уонга. [c.18] Как пример сортирования по узлам подчеркнуты те члены, которые соответствуют определителю узла 2 (не содержат 2 или 1 ). [c.18] Вернуться к основной статье