ПОИСК Статьи Рисунки Таблицы Кинетика сложных ферментативных реакций из "Молекулярная биофизика" Это условие эквивалентно условию стационарности реакции. [c.462] Граф для стационарной системы показан на рис. 7.31. Нахождение стационарной скорости производится по простым правилам без громоздких расчетов. Определим некоторые понятия. [c.463] Деревом графа, направленны в данный узел, называется obo-, купность ветвей, соединяющих все узлы графа без образования замкнутых циклов и направленных в этот узел. Так, в узел ЕМ направлено 10 деревьев (рис. 7.32). [c.463] Циклом называется непрерывная последовательность йетвей, направленных в одну сторону. Определителем узла i называется сумма величин всех деревьев, направленных в этот узел. [c.463] Дальнейшее усовершенствование некоторых деталей метода, развитого в [97], было проведено в работе Фромма [101]. [c.465] Механизмы быстрого равновесия могут быть однозначно восстановлены по экспериментальным данным о зависимости скоростей реакции от концентраций лигандов [105, 106]. [c.466] Метод графов позволяет обобщить различные модели АСФ [65, 74, 75]. Все эти модели можно представить единым графом, который однозначно определяется по зависимости начальной стационарной скорости от концентраций лигандов. [c.466] Ех Е У т. д. равны соответственно 1, 2 и т. д. Константы ассоциации лиганда для одного центра в состояниях о. Ей Ei равны соотвественно ф1А ,. .., ццК Константы скоростей медленных стадий во всех состояниях одинаковы. Граф имеет вид, показанный на рис. 7.35. Для такого дерева находим V, определив пути из узла Ео во все узлы графа (рис. 7.35). [c.467] Этот случай эквивалентен меньшему сродству к первой молекуле лиганда по сравнению с последующими, т. е. Ki Ki = = Kz =. .. = Кп. [c.468] Таким образом, модели квазиравновесных реакций для ферментов с любым числом центров представляются единым графом, по соотношению параметров которого можно установить пригодность той или иной модели. Однозначность восстановления графа по экспериментальной кривой зависит от точности эксперимента (ср. [109]). [c.468] Прямые методы для выявления медленной стадии и, следовательно, для нахождения подграфов быстрого равновесия даюг релаксационная (см. ниже) и предстационарная (см. [ПО]) кинетики. Вместе с тем некоторые критерии применимости квазиравновесного приближения можно получить из анализа кривой для начальной стационарной скорости и функции насыщения. [c.468] Для ряда ферментов наблюдаются кривые о(5) с промежуточными плато (см., например, [111]). В рамках модели МУШ такие кривые получить нельзя. Напротив, они хорошо объясняются в предположении о сочетании положительной и отрицательной кооперативности [109]. Последняя для модели МУШ невозможна. [c.469] На кривых насыщения вообще не могут появляться промежуточные плато. Кривизна этих графиков имеет ограничения сверху и снизу (см. [112]). Число точек перегиба на кривых насыщения также ограничено числом центров для п = 1 их нет, для п = 2 возможна только одна точка перегиба, для п = 3 — две, для п = 4 —три точки перегиба. Это легко показать, определяя число положительных корней многочлена методом Декарта (см. [113]). В отличие от функции насыщения график и(8) может иметь экстремумы. Рассмотрим условия появления промежуточных максимумов и 8) для тетрамерного фермента. Положим для простоты, что все константы К одинаковы, т. е. [c.469] Дальнейшее развитие стационарной кинетики реакций, кат.ч-лизируемых кооперативными ферментами, как при наличии, так и в отсутствие детального равновесия, а также анализ экспериментальных кривых можно найти в работах Гольдштейна и др. [107, 114, 115], Курганова и др. [78—80, 116, 117], Магаршака и др. [102—106]. [c.469] В предстационарном режиме предполагается, что можно пренебречь зависимостью от времени концентраций лигандов, так как они мало меняются по сравнению с [ЕХ . Поэтому Т1)ц в уравнениях (7,91) постоянны. [c.470] Применение интегрального преобразования Лапласа—Карсона к системе (7,91) превращает ее в систему алгебраических уравнений, которую можно решать методом графов [33, 116, 118]. [c.470] Вернуться к основной статье